普通野生稻優(yōu)異基因發(fā)掘平臺建立
記者11日從中國農(nóng)業(yè)科學院獲悉,,該院作物科學研究所水稻優(yōu)異種質(zhì)資源創(chuàng)新利用團隊聯(lián)合北京大學現(xiàn)代農(nóng)學院,,首次組裝了普通野生稻單倍型無間隙染色體基因組,,構(gòu)建了野生稻種質(zhì)資源優(yōu)異基因發(fā)掘利用與種質(zhì)創(chuàng)新平臺,,并鑒定了關(guān)鍵的耐鹽與抗稻瘟病基因。相關(guān)研究成果日前發(fā)表在國際期刊《自然?通訊》上,。
栽培稻是從二倍體普通野生稻馴化而來,,現(xiàn)在已成為世界上超過一半人口的主食。然而,,在栽培稻的馴化和育種過程中,,非生物耐受性和生物抗性等許多有益性狀丟失或者被削弱,。而且,,野生稻雜合度高導致基因組組裝困難,,大量優(yōu)異抗性基因與不利性狀連鎖,育種中更難以直接利用,。所以,,建立一個可用于野生稻基因發(fā)掘的高效平臺,對于野生稻資源利用和水稻品種改良具有重要意義,。
論文通訊作者,、中國農(nóng)業(yè)科學院作物科學研究所研究員楊慶文告訴記者,研究團隊以綜合抗性優(yōu)良的中國普通野生稻“Y476”為載體,,首次組裝了單倍型無間隙染色體基因組,。他們以此為基礎,分別以秈稻“9311”和粳稻“日本晴”為受體親本,,構(gòu)建了兩套覆蓋全基因組的染色體片段置換系,,創(chuàng)建了一個能夠高通量鑒定發(fā)掘野生稻優(yōu)異基因的平臺。
“在這項工作中,,我們通過整合高通量高分辨率染色體構(gòu)象捕捉,、全基因組光學圖譜、納米孔測序和高保真測序等技術(shù),,對二倍體普通野生稻種質(zhì)進行單倍型解析的無間隙基因組組裝和注釋,。與之前組裝的二倍體普通野生稻基因組相比,該基因組組裝在連續(xù)性,、完整性和正確性方面有了顯著改善,。這意味著,該平臺將加速野生稻的功能基因組學研究,,并為稻種資源利用與品種遺傳改良提供先進工具,。”楊慶文說,。
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